Publications


Publications HAL de Aurélie,Bugeau; Vinh-Thong,Ta; Vinh Thong, Ta; Pierrick, Coupé; Pierrick, Coupe,

2017

Journal articles

titre
Joint inpainting of depth and reflectance with visibility estimation
auteur
Marco Bevilacqua, Jean-François Aujol, Pierre Biasutti, Mathieu Brédif, Aurélie Bugeau
article
ISPRS Journal of Photogrammetry and Remote Sensing, Elsevier, 2017, 125, pp.16--32. <10.1016/j.isprsjprs.2017.01.005>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01439299/file/jrnl_jointinp.pdf BibTex
titre
Interactive Video Colorization within a Variational Framework
auteur
Fabien Pierre, Jean-François Aujol, Aurélie Bugeau, Vinh-Thong Ta
article
SIAM Journal of Imaging Sciences, 2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01379702/file/papier_siims_final.pdf BibTex
titre
A comparison of accurate automatic hippocampal segmentation methods
auteur
Azar Zandifar, Vladimir Fonov, Pierrick Coupé, Jens Pruessner, D Louis Collins
article
NeuroImage, Elsevier, 2017, <10.1016/j.neuroimage.2017.04.018>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01520108/file/NI2017_HAL.pdf BibTex
titre
SuperPatchMatch: an Algorithm for Robust Correspondences using Superpixel Patches
auteur
Rémi Giraud, Vinh-Thong Ta, Aurélie Bugeau, Pierrick Coupé, Nicolas Papadakis
article
IEEE Transactions on Image Processing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, <10.1109/TIP.2017.2708504>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01432116/file/Giraud_TIP_SPM.pdf BibTex

Conference papers

titre
DISOCCLUSION OF 3D LIDAR POINT CLOUDS USING RANGE IMAGES
auteur
Pierre Biasutti, Jean-François Aujol, Mathieu Brédif, Aurélie Bugeau
article
ISPRS International Society for Photogrammetry and Remote Sensing (CMRT), Jun 2017, Hannover, Germany
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01522366/file/isprs_cmrt_2017.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Décomposition en superpixels via l’utilisation de chemin linéaire
auteur
Rémi Giraud, Vinh-Thong Ta, Nicolas Papadakis
article
Groupe d'Études du Traitement du Signal et des Images (GRETSI). 2017
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titre
Transfert de couleurs basé superpixels
auteur
Rémi Giraud, Vinh-Thong Ta, Nicolas Papadakis
article
Groupe d'Études du Traitement du Signal et des Images (GRETSI). 2017
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BibTex
titre
Evaluation Framework of Superpixel Methods with a Global Regularity Measure
auteur
Rémi Giraud, Vinh-Thong Ta, Nicolas Papadakis
article
Journal of Electronic Imaging (JEI), Special issue on Superpixels for Image Processing and Comput.. 2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01519635/file/Giraud_JEI_GR.pdf BibTex
titre
Superpixel-based Color Transfer
auteur
Rémi Giraud, Vinh-Thong Ta, Nicolas Papadakis
article
IEEE International Conference on Image Processing (ICIP) 2017. 2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01519644/file/Giraud_SCT_ICIP17.pdf BibTex
titre
Robust Shape Regularity Criteria for Superpixel Evaluation
auteur
Rémi Giraud, Vinh-Thong Ta, Nicolas Papadakis
article
IEEE International Conference on Image Processing (ICIP). 2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01510062/file/Giraud_SRC_ICIP17.pdf BibTex
titre
Robust Superpixels using Color and Contour Features along Linear Path
auteur
Rémi Giraud, Vinh-Thong Ta, Nicolas Papadakis
article
2017
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01510063/file/Giraud_SCALP.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
Posterior lobules of the cerebellum and information processing speed at various stages of multiple sclerosis
auteur
Amandine Moroso, Aurélie Ruet, Delphine Lamargue-Hamel, Fanny Munsch, Mathilde Deloire, Pierrick Coupé, Jean-Christophe Ouallet, Vincent Planche, Nicolas Moscufo, Dominik S Meier, Thomas Tourdias, Charles R G Guttmann, Vincent Dousset, Bruno Brochet
article
Journal of Neurology, Neurosurgery and Psychiatry, BMJ Publishing Group, 2016, <10.1136/jnnp-2016-313867>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01398727/file/Moroso_JNNP_2016_Final_HAL.pdf BibTex
titre
Optic Radiations Microstructural Changes in Glaucoma and Association With Severity: A Study Using 3Tesla-Magnetic Resonance Diffusion Tensor Imaging
auteur
Laury Tellouck, Muriel Durieux, Pierrick Coupé, Audrey Cougnard-Grégoire, Joy Tellouck, Thomas Tourdias, Fanny Munsch, Arnaud Garrigues, Catherine Helmer, Florence Malet, Jean-François Dartigues, Vincent Dousset, Cecile Delcourt, Cédric Schweitzer
article
Investigative Opthalmology & Visual Science, 2016, 57, pp.6539 - 6539. <10.1167/iovs.16-19838>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01456234/file/IOVS_Tellouck_2016_HAL.pdf BibTex
titre
Automatic thalamus and hippocampus segmentation from MP2RAGE: comparison of publicly available methods and implications for DTI quantification
auteur
Erhard Næss-Schmidt, Anna Tietze, Jakob Udby Blicher, Mikkel Petersen, Irene K. Mikkelsen, Pierrick Coupé, José V. Manjón, Simon Fristed Eskildsen
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2016, <10.1007/s11548-016-1433-0>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01344412/file/IJCAS_Manuscript_22_03_16.pdf BibTex
titre
Hippocampal microstructural damage correlates with memory impairment in clinically isolated syndrome suggestive of multiple sclerosis
auteur
Vincent Planche, Aurélie Ruet, Pierrick Coupé, Delphine Lamargue-Hamel, Mathilde Deloire, Bruno Pereira, José Manjon, Fanny Munsch, Nicola Moscufo, Dominik Meier, Charles Guttmann, Vincent Dousset, Bruno Brochet, Thomas Tourdias
article
Multiple Sclerosis, SAGE Publications, 2016, 33, pp.1596 - 1596. <10.1177/1352458514567727>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01456230/file/Manuscript_MSJ_3_table_fig.pdf BibTex
titre
Non Local Spatial and Angular Matching : Enabling higher spatial resolution diffusion MRI datasets through adaptive denoising
auteur
Samuel St-Jean, Pierrick Coupé, Maxime Descoteaux
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2016, <10.1016/j.media.2016.02.010>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01294850/file/stjean-etal-media16.pdf BibTex
titre
CERES: A new cerebellum lobule segmentation method
auteur
Jose Romero, Pierrick Coupé, Rémi Giraud, Vinh-Thong Ta, Vladimir Fonov, Min Tae Park, Mallar Chakravarty, Aristotle Voineskos, Jose Manjón
article
NeuroImage, Elsevier, 2016, <10.1016/j.neuroimage.2016.11.003>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01398748/file/CERES_manuscript_final_HAL.pdf BibTex
titre
Early Fiber Number Ratio Is a Surrogate of Corticospinal Tract Integrity and Predicts Motor Recovery After Stroke
auteur
Antoine Bigourdan, Fanny Munsch, Pierrick Coupé, Charles Guttmann, Sharmila Sagnier, Pauline Renou, Sabrina Debruxelles, Mathilde Poli, Vincent Dousset, Igor Sibon, Thomas Tourdias
article
Stroke, American Heart Association, 2016, <10.1161/STROKEAHA.115.011576>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01294872/file/Bigourdan_Stroke_2016_HALversion.pdf BibTex

Conference papers

titre
SCALP: Superpixels with Contour Adherence using Linear Path
auteur
Rémi Giraud, Vinh-Thong Ta, Nicolas Papadakis
article
23rd International Conference on Pattern Recognition (ICPR 2016), Dec 2016, Cancun, Mexico. <http://www.icpr2016.org/site/>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01349569/file/Giraud_ICPR_2016.pdf BibTex
titre
Patch-based DTI grading: Application to Alzheimer's disease classication
auteur
Kilian Hett, Vinh-Thong Ta, Rémi Giraud, Mary Mondino, José Manjón, Pierrick Coupé
article
Second International Workshop, Patch-MI 2016, Held in Conjunction with MICCAI 2016, Oct 2016, Athens, Greece. 9993 2016, 2016, Patch-Based Techniques in Medical Imaging
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01395487/file/patchmi_12.pdf BibTex
titre
Sparse-Based Morphometry: Principle and Application to Alzheimer's Disease
auteur
Pierrick Coupé, Charles Deledalle, Charles Dossal, Michèle Allard
article
Patch-Based Techniques in Medical Imaging, Oct 2016, Athènes, Greece. Lecture Notes in Computer Science, Patch-Based Techniques in Medical Imaging. <10.1007/978-3-319-47118-1_6>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01398763/file/MICCAI_SBM.pdf BibTex
titre
High Resolution Hippocampus Subfield Segmentation Using Multispectral Multiatlas Patch-Based Label Fusion
auteur
José Romero, Pierrick Coupé, José Manjón
article
Patch-Based Techniques in Medical Imaging, Oct 2016, Athènes, Greece. Lecture Notes in Computer Science, pp.117 - 124, 2016, Patch-Based Techniques in Medical Imaging. <10.1007/978-3-319-47118-1_15>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01398769/file/PatchMI_HIPS_submission_final.pdf BibTex
titre
HIST: HyperIntensity Segmentation Tool
auteur
Jose Manjón, Pierrick Coupé, Parnesh Raniga, Ying Xia, Jurgen Fripp, Olivier Salvado
article
Patch-Based Techniques in Medical Imaging, Oct 2016, Athènes, Greece. Lecture Notes in Computer Science, pp.92 - 99, 2016, Patch-Based Techniques in Medical Imaging. <10.1007/978-3-319-47118-1_12>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01398773/file/PatchMI_HIST_seg_final.pdf BibTex
titre
Non-local MRI Library-Based Super-Resolution: Application to Hippocampus Subfield Segmentation
auteur
Jose Romero, Pierrick Coupé, Jose Manjón
article
Patch-Based Techniques in Medical Imaging, Oct 2016, Athènes, Greece. Lecture Notes in Computer Science, pp.68 - 75, 2016, Patch-Based Techniques in Medical Imaging. <10.1007/978-3-319-47118-1_9>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01398781/file/PatchMI_library_based_SR_final.pdf BibTex
titre
Visibility Estimation and Joint Inpainting of Lidar Depth Maps
auteur
Marco Bevilacqua, Jean-François Aujol, Mathieu Brédif, Aurélie Bugeau
article
IEEE International Conference on Image Processing (ICIP), Sep 2016, Phoenix, AZ, United States
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01316719/file/icip16_marco.pdf BibTex
titre
Cultural differences in pattern matching: multisensory recognition of socio-affective prosody
auteur
Takaaki Shochi, Jean-Luc Rouas, Zuheng Ming, Marine Guerry, Aurélie Bugeau, Erickson Donna
article
International Congress of Psychology, Jul 2016, Yokohama, Japan
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BibTex
titre
Diffusion anisotrope et inpainting d'orthophotographies LiDAR mobile
auteur
P. Biasutti, Jean-François Aujol, Mathieu Brédif, Aurélie Bugeau
article
20ème Congrès national sur la Reconnaissance des Formes et l'Intelligence Artificielle (RFIA 2016), Jun 2016, Clermont-Ferrand, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01316487/file/biasutti2016orthophoto.pdf BibTex
titre
HUE-PRESERVING PERCEPTUAL CONTRAST ENHANCEMENT
auteur
Fabien Pierre, Jean-François Aujol, Aurélie Bugeau, Gabriele Steidl, Vinh-Thong Ta
article
Internationnal Conference on Image Processing, Jun 2016, Phoenix, United States. ICIP 2016 2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01316432/file/icip2016.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Joint Inpainting of Depth and Reflectance with Visibility Estimation
auteur
Marco Bevilacqua, Jean-François Aujol, Mathieu Brédif, Aurélie Bugeau
article
2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01348304/file/jrnl_jointinp_v05_sub1.pdf BibTex
titre
Diffusion and inpainting of reflectance and height LiDAR orthoimages
auteur
Pierre Biasutti, Jean-François Aujol, Mathieu Brédif, Aurélie Bugeau
article
2016
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01322822/file/paper.pdf BibTex

2015

Journal articles

titre
Non-Local Means Inpainting of MS Lesions in Longitudinal Image Processing
auteur
Nicolas Guizard, Kunio Nakamura, Pierrick Coupé, Vladimir S. Fonov, Douglas L. Arnold, D. Louis Collins
article
Frontiers in Aging Neuroscience, Frontiers, 2015, 9, <10.3389/fnins.2015.00456>
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BibTex
titre
Detection of Alzheimer's disease signature in MR images seven years before conversion to dementia: Toward an early individual prognosis.
auteur
Pierrick Coupé, Vladimir S Fonov, Charlotte Bernard, Azar Zandifar, Simon F Eskildsen, Catherine Helmer, José V Manjón, Hélène Amieva, Jean-François Dartigues, Michèle Allard, Gwenaelle Catheline, D Louis Collins
article
Human Brain Mapping, Wiley, 2015, <10.1002/hbm.22926>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01219781/file/HBM_SNIPE3C_Final_HAL.pdf BibTex
titre
Standardized evaluation of algorithms for computer-aided diagnosis of dementia based on structural MRI: the CADDementia challenge.
auteur
Esther E Bron, Marion Smits, Wiesje M Van Der Flier, Hugo Vrenken, Frederik Barkhof, Philip Scheltens, Janne M Papma, Rebecca M E Steketee, Carolina Méndez Orellana, Rozanna Meijboom, Madalena Pinto, Joana R Meireles, Carolina Garrett, António J Bastos-Leite, Ahmed Abdulkadir, Olaf Ronneberger, Nicola Amoroso, Roberto Bellotti, David Cárdenas-Peña, Andrés M Álvarez-Meza, Chester V Dolph, Khan M Iftekharuddin, Simon F Eskildsen, Pierrick Coupé, Vladimir S Fonov, Katja Franke, Christian Gaser, Christian Ledig, Ricardo Guerrero, Tong Tong, Katherine R Gray, Elaheh Moradi, Jussi Tohka, Alexandre Routier, Stanley Durrleman, Alessia Sarica, Giuseppe Di Fatta, Francesco Sensi, Andrea Chincarini, Garry M Smith, Zhivko V Stoyanov, Lauge Sørensen, Mads Nielsen, Sabina Tangaro, Paolo Inglese, Christian Wachinger, Martin Reuter, John C Van Swieten, Wiro J Niessen, Stefan Klein
article
NeuroImage, Elsevier, 2015, 111, pp.562-79. <10.1016/j.neuroimage.2015.01.048>
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BibTex
titre
MRI noise estimation and denoising using non-local PCA
auteur
José V. Manjón, Pierrick Coupé, Antonio Buades
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2015, 22 (1), pp.35-47. <10.1016/j.media.2015.01.004>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01116697/file/MRI%20Noise%20Estimation%20and%20Denoising_final.pdf BibTex
titre
NABS: Non-local Automatic Brain Hemisphere Segmentation.
auteur
José E Romero, José V Manjón, Jussi Tohka, Pierrick Coupé, Montserrat Robles
article
Magnetic Resonance Imaging, Elsevier, 2015, In press. <10.1016/j.mri.2015.02.005>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01116696/file/Romero_MRI_NABS_hal.pdf BibTex
titre
Luminance-Chrominance Model for Image Colorization
auteur
F Pierre, J.-F Aujol, Aurélie Bugeau, Nicolas Papadakis, V.-T Ta
article
SIAM J. on Imaging Sciences, 2015, pp.536-563. <10.1137/140979368>
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BibTex
titre
Rotation-invariant multi-contrast non-local means for MS lesion segmentation
auteur
Nicolas Guizard, Pierrick Coupé, Vladimir S. Fonov, Jose V. Manjón, Douglas L. Arnold, D. Louis Collins
article
Neuroimage: Clinical, 2015, 8, pp.376--389. <10.1016/j.nicl.2015.05.001>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01178544/file/Guizard2015_NIC.pdf BibTex
titre
An Optimized PatchMatch for multi-scale and multi-feature label fusion
auteur
Rémi Giraud, Vinh-Thong Ta, Nicolas Papadakis, Jose Vicente Manjon, D Louis Collins, Pierrick Coupé
article
NeuroImage, Elsevier, 2015, pp.40. <10.1016/j.neuroimage.2015.07.076>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01198703/file/Giraud_2015_NR.pdf BibTex

Conference papers

titre
Patch-Based Segmentation from MP2RAGE Images: Comparison to Conventional Techniques
auteur
Erhard Naess-Schmidt, Anna Tietze, Irene Mikkelsen, Mikkel Petersen, Jakob Blicher, Pierrick Coupé, José Manjón, Simon Eskildsen
article
Springer; Guorong Wu, Pierrick Coupé, Yiqiang Zhan, Brent Munsell, Daniel Rueckert First International Workshop on Patch-based Techniques in Medical Images (Patch-MI 2015), Oct 2015, Munich, Germany. Patch-Based Techniques in Medical Imaging First International Workshop, Patch-MI 2015, held in conjunction with MICCAI 2015, Munich, Germany, October 9, 2015, Revised Selected Papers, 9467, pp.180-187, 2016, Lecture Notes in Computer Science. <10.1007/978-3-319-28194-0_22>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01290510/file/Naess-Schmidt_Segmentation-comparisons-Camera-Ready.pdf BibTex
titre
Hippocampal microstructural damage and memory impairment in clinically isolated syndrome
auteur
Vincent Planche, Aurélie Ruet, Pierrick Coupé, Delphine Lamargue, Mathilde Deloire, Fanny Munsch, Aurore Saubusse, Julie Charré-Morin, Nicolas Moscufo, Dominik Meier, C. Guttmann, Vincent Dousset, Bruno Brochet, Thomas Tourdias
article
ECTRIMS, Oct 2015, Barcelona, Spain. 21, pp.363, Multiple Sclerosis Journal. <http://onlinelibrary.ectrims-congress.eu/ectrims/2015/31st/115657/undefined>
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BibTex
titre
Cerebellar sub-structures in cognitive impairment: volumetric and microstructural analyses at different stages of multiple sclerosis
auteur
Amadine Moroso, Aurélie Ruet, Delphine Lamargue, Fanny Munsch, Mathilde Deloire, Pierrick Coupé, Jean-Christophe Ouallet, Vincent Planche, Nicolas Moscufo, Dominik Meier, Thomas Tourdias, C. Guttmann, Vincent Dousset, Bruno Brochet
article
ECTRIMS, Oct 2015, Barcelona, Spain. 21, pp.365, Multiple Sclerosis Journal. <http://www.ectrims-congress.eu/2015/ectrims-2015.html#&panel1-3>
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BibTex
titre
Formal Accountability for Biometric Surveillance: A Case Study
auteur
Daniel Le Métayer, Denis Butin, Vinh-Thong Ta
article
Annual Privacy Forum (APF 2015), Oct 2015, Luxembourg, Luxembourg. Springer 2016
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BibTex
titre
FACE DE-IDENTIFICATION WITH EXPRESSIONS PRESERVATION
auteur
Geoffrey Letournel, Aurélie Bugeau, Vinh-Thong Ta, Jean-Philippe Domenger
article
International Conference on Image Processing (ICIP) 2015, Sep 2015, Quebec, Canada
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01187654/file/388-wDbe-301.pdf BibTex
titre
Combinaison linéaire optimale de métriques pour la colorisation d'images
auteur
Fabien Pierre, Jean-François Aujol, Aurélie Bugeau, Vinh-Thong Ta
article
GRETSI, Sep 2015, Lyon, France. 2015
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01168540/file/main_gretsi.pdf BibTex
titre
Optimisation de l'algorithme PatchMatch pour la segmentation de structures anatomiques
auteur
Rémi Giraud, Vinh-Thong Ta, Nicolas Papadakis, D. Louis Collins, Pierrick Coupé
article
GRETSI 2015, Sep 2015, Lyon, France. 2015
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01170197/file/Giraud_2015_GRETSI.pdf BibTex
titre
volBrain: An online MRI brain volumetry system
auteur
Jose Vicente Manjon, Pierrick Coupé
article
Organization for Human Brain Mapping’15, Jun 2015, Honolulu, United States
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01180069/file/OHBM2015_volBrain.pdf BibTex
titre
Luminance-Hue Specification in the RGB Space
auteur
Fabien Pierre, Jean-François Aujol, Aurélie Bugeau, Vinh-Thong Ta
article
Scale-Space and Variational Method in Computer Vision, Jun 2015, Lège Cap-Ferret., France. 2015, Scale space and variational method in computer vision. <10.1007/978-3-319-18461-6_33>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01168528/file/pierre2015ssvm.pdf BibTex
titre
Facial Action Units Intensity Estimation by the Fusion of Features with Multi-kernel Support Vector Machine
auteur
Zuheng Ming, Aurélie Bugeau, Jean-Luc Rouas, Takaaki Shochi
article
11th IEEE International Conference on Automatic Face and Gesture Recognition Conference and Workshops, May 2015, Ljubljana, Slovenia. Proceedings of the 11th IEEE International Conference on Automatic Face and Gesture Recognition Conference and Workshops
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01126775/file/Using%20the%20Fusion%20of%20differernt%20features%20for%20Facial%20Action%20Unit%20Intensity%20Predictioin%20by%20the%20fusion%20of%20by%20Multikernel%20SVM_cameraready.pdf BibTex
titre
Synthetic Evidential Study as Augmented Collective Thought Process -- Preliminary Report
auteur
Nishida Toyoaki, Abe Masakazu, Ookaki Takashi, Lala Divesh, Thovuttikul Sutasinee, Song Hengjie, Mohammad Yasser, Nitschke Christian, Ohmoto Yoshimasa, Nakazawa Atsushi, Takaaki Shochi, Jean-Luc Rouas, Aurélie Bugeau, Fabien Lotte, Zuheng Ming, Geoffrey Letournel, Marine Guerry, Dominique Fourer
article
ACIIDS, Mar 2015, Bali, France
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Preprints, Working Papers, ...

titre
Variational Contrast Enhancement of RGB Images
auteur
Fabien Pierre, Jean-François Aujol, Aurélie Bugeau, Gabriele Steidl, Vinh-Thong Ta
article
2015
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01237038/file/work_document.pdf BibTex

2014

Journal articles

titre
Structural imaging biomarkers of Alzheimer's disease: predicting disease progression
auteur
Simon Eskildsen, Pierrick Coupé, Vladimir Fonov, Jens Pruessner, Louis Collins
article
Neurobiology of Aging, Elsevier, 2014, <10.1016/j.neurobiolaging.2014.04.034>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01060331/file/EskildsenNBA2014-HAL-version.pdf BibTex
titre
NICE: Non-local Intracranial Cavity Extraction
auteur
José Manjón, Simon Eskildsen, Pierrick Coupé, José Romero, Louis Collins, Montserrat Robles
article
International Journal of Biomedical Imaging, Hindawi Publishing Corporation, 2014
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01060348/file/Manjon_IJBI2014.pdf BibTex
titre
A UNIFIED ASSESSMENT OF FULLY AUTOMATED HIPPOCAMPUS SEGMENTATION METHODS
auteur
Azar Zandifar, Vladimir Fonov, Pierrick Coupé, Jens C. Pruessner, D. Louis Collins
article
Alzheimer's and Dementia, Elsevier, 2014, 10 (4), pp.86. <10.1016/j.jalz.2014.05.156>
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BibTex
titre
Variational Exemplar-Based Image Colorization
auteur
Aurélie Bugeau, Vinh-Thong Ta, Nicolas Papadakis
article
IEEE Transactions on Image Processing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2014, 23 (1), pp.TIP.2013.2288929. <10.1109/TIP.2013.2288929>
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Conference papers

titre
Privacy by Design: On the Conformance Between Protocols and Architectures
auteur
Vinh-Thong Ta, Thibaud Antignac
article
Fong, Philip W. L.; Cuppens, Frédéric; Garcia-Alfaro, Joaquin; Zincir Heywood, Nur. FPS - 7th International Symposium on Foundations & Practice of Security, Nov 2014, Montreal, Canada. Springer, <http://conferences.telecom-bretagne.eu/fps/2014/>
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https://hal.inria.fr/hal-01103546/file/fps14_final.pdf BibTex
titre
EXEMPLAR-BASED COLORIZATION IN RGB COLOR SPACE
auteur
Fabien Pierre, Jean-François Aujol, Aurélie Bugeau, Nicolas Papadakis, Vinh-Thong Ta
article
Internationnal Conference on Image Processing, Oct 2014, Paris, France. pp.1-5, 2014
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01019627/file/pierre2014exemplar.pdf BibTex
titre
Bag-of-Bags of Words - Irregular Graph Pyramids vs Spatial Pyramid Matching for Image Retrieval
auteur
Yi Ren, Aurélie Bugeau, Jenny Benois-Pineau
article
4th International Conference on Image Processing Theory, Tools and Applications, Oct 2014, Paris, France. paper 470, 2014
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titre
Optimized PatchMatch for Near Real Time and Accurate Label Fusion
auteur
Vinh-Thong Ta, Rémi Giraud, D. Louis Collins, Pierrick Coupé
article
MICCAI 2014, Sep 2014, United States. 8 p., 2014
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titre
Anatomically Constrained Weak Classifier Fusion for Early Detection of Alzheimer's Disease
auteur
Mawulawoé Komlagan, Vinh-Thong Ta, Xingyu Pan, Jean-Philippe Domenger, D. Louis Collins, Pierrick Coupé
article
5th International Workshop on Machine Learning in Medical Imaging, Sep 2014, United States. 8 p., 2014
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01062759/file/gmgrading.pdf BibTex
titre
A Unified Model for Image Colorization
auteur
Fabien Pierre, Jean-François Aujol, Aurélie Bugeau, Vinh-Thong Ta
article
CPCV workshop, ECCV 2014, Sep 2014, Zürich, France. pp.1-12, 2014
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titre
Anonymisation fine de visages avec préservation des expressions faciales
auteur
Geoffrey Letournel, Aurélie Bugeau, Vinh-Thong Ta, Jean-Philippe Domenger, Maria Caterina Manes Gallo
article
Reconnaissance de Formes et Intelligence Artificielle (RFIA) 2014, Jun 2014, Rouen, France. pp.6, 2014
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titre
A Comparative Study of Irregular Pyramid Matching in Bag-of-Bags of Words Model for Image Retrieval
auteur
Yi Ren, Jenny Benois-Pineau, Aurélie Bugeau
article
Elmoataz, Abderrahim; Lezoray, Olivier; Nouboud, Fathallah; Mammass, Driss. Image and Signal Processing, International Conference ICISP 2014, Jun 2014, Cherbourg, Normandy, France. Springer, 8509, pp.539 - 548, 2014, Lecture Notes in Computer Science
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titre
Impact of DWI denoising on Track-Density Imaging
auteur
Pierrick Coupé, Olivier Périot, Jose Vicente Manjon, Bassem Hiba, Michèle Allard
article
Organization for Human Brain Mapping 2014 Annual Meeting, Jun 2014, Germany. 2014
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00961150/file/Coupe_OHBM2014.pdf BibTex
titre
Non-local PCA-based MRI denoising
auteur
Jose Vicente Manjon, Pierrick Coupé, Antoni Buades
article
Organization for Human Brain Mapping 2014 Annual Meeting, Jun 2014, Hamburg, Germany. 2014
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titre
Non Local Spatial and Angular Matching : a new denoising technique for diffusion MRI
auteur
Samuel St-Jean, Pierrick Coupé, Maxime Descoteaux
article
Joint Annual Meeting ISMRM-ESMRMB 2014, May 2014, Italy. 2014
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Book sections

titre
Visual search for objects in a complex visual context: what we wish to see
auteur
Hugo Boujut, Aurélie Bugeau, Jenny Benois-Pineau
article
Evaggelos Spyrou, Dimitris Iakovidis, Phivos Mylonas. Semantic Multimedia Analysis and Processing, CRC Press, p., 2014, Digital Imaging and Computer Vision
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00993264/file/CRCBook_Saliency_boujut_bugeau_benois-pineau.pdf BibTex

Reports

titre
Bag-of-Bags of Words : Irregular graph pyramids vs spatial pyramid matching for image retrieval
auteur
Yi Ren, Aurélie Bugeau, Jenny Benois-Pineau
article
2014
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00992088/file/rfia2014_submission_16.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Luminance-Chrominance Model for Image Colorization
auteur
Fabien Pierre, Jean-François Aujol, Aurélie Bugeau, Nicolas Papadakis, Vinh-Thong Ta
article
2014
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01051308/file/pierre2014variational.pdf BibTex
titre
Hue Constrained Image Colorization in the RGB Space
auteur
Fabien Pierre, Jean-François Aujol, Aurélie Bugeau, Vinh-Thong Ta
article
2014
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00995724/file/pierre_aujol_bugeau_ta_2014.pdf BibTex

2013

Journal articles

titre
Diffusion Weighted Image Denoising Using Overcomplete Local PCA
auteur
José Manjón, Pierrick Coupé, Luis Concha, Antoni Buades, Louis Collins, Robles Montserrat
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (9), pp.e73021. <10.1371/journal.pone.0073021>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00871777/file/Manjon2013_LPCA_plos_one.pdf BibTex
titre
Virtual camera synthesis for soccer game replays
auteur
Nicolas Papadakis, Antonio Baeza, Aurélie Bugeau, Pau Gargallo I Piracés, Olivier D'Hondt, Vicent Caselles, Xavier Armangué, Ignasi Rius, Sergi Sagàs
article
Journal of Virtual Reality and Broadcasting, Digital Peer Publishing NRW, 2013, 9(2012) (5)
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titre
Collaborative patch-based super-resolution for diffusion-weighted images.
auteur
Pierrick Coupé, José V Manjón, Maxime Chamberland, Maxime Descoteaux, Bassem Hiba
article
NeuroImage, Elsevier, 2013, epub ahead of print. <10.1016/j.neuroimage.2013.06.030>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00842213/file/Coupe_NI_CLASR_2013.pdf BibTex
titre
Segmentation of MR images via discriminative dictionary learning and sparse coding: Application to hippocampus labeling.
auteur
Tong Tong, Robin Wolz, Pierrick Coupé, Joseph V Hajnal, Daniel Rueckert
article
NeuroImage, Elsevier, 2013, epub ahead of print. <10.1016/j.neuroimage.2013.02.069>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00806384/file/Tong_Neuroimage2013.pdf BibTex
titre
Volumetric analysis of medial temporal lobe structures in brain development from childhood to adolescence.
auteur
Shiyan Hu, Jens C Pruessner, Pierrick Coupé, D Louis Collins
article
NeuroImage, Elsevier, 2013, 74C, pp.276-287. <10.1016/j.neuroimage.2013.02.032>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00804345/file/volume_nihpd.pdf BibTex
titre
Automated segmentation of basal ganglia and deep brain structures in MRI of Parkinson's disease
auteur
Claire Haegelen, Pierrick Coupé, Vladimir Fonov, Nicolas Guizard, Pierre Jannin, Xavier Morandi, D Louis Collins
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2013, 8 (1), pp.99-110. <10.1007/s11548-012-0675-8>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683777/file/hal-00683777_edited.pdf https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683777/file/Heagelen_IJCARS2012_HAL.pdf BibTex

Conference papers

titre
Particle Swarm Optimization in Multi-Tensor Imaging
auteur
Micheal Paquette, Eleftherios Garyfallidis, Samuel St-Jean, Pierrick Coupé, Maxime Descoteaux
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2013), Apr 2013, United States. pp.16, 2013
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00829323/file/scil-pso_abstract.pdf BibTex
titre
Deconvolution enhanced Generalized Q-Sampling 2 and DSI deconvolution
auteur
Eleftherios Garyfallidis, Michael Paquette, Samuel St-Jean, Pierrick Coupé, Maxime Descoteaux
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2013), Apr 2013, United States. pp.18, 2013
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00829320/file/GQID_DSID_Abstract_ISBI_2013.pdf BibTex
titre
Constrained spherical deconvolution on signal and ODF values
auteur
Eleftherios Garyfallidis, Samuel St-Jean, Michael Paquette, Pierrick Coupé, Maxime Descoteaux
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2013), Apr 2013, United States. pp.17, 2013
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00829328/file/SDT_CSD_Abstract_ISBI_2013.pdf BibTex
titre
Segmentation d'images par approximation du Cheeger Cut
auteur
Ludovic Paulhac, Vinh-Thong Ta, Rémi Mégret
article
GRETSI, 2013, France. 2013
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Reports

titre
Bag-of-Bags of Words model over irregular graph partitions for image retrieval
auteur
Yi Ren, Aurélie Bugeau, Jenny Benois-Pineau
article
2013
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00976939/file/submitICPR2014_FinalVersion.pdf BibTex
titre
Visual object retrieval by graph features
auteur
Yi Ren, Aurélie Bugeau, Jenny Benois-Pineau
article
2013
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00977125/file/gretsi_resumefr.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Variational Exemplar-Based Image Colorization
auteur
Aurélie Bugeau, Vinh-Thong Ta, Nicolas Papadakis
article
RR-1470-13. 2013
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https://hal.inria.fr/hal-00803219/file/ip2013_preprint.pdf BibTex
titre
Visual search for objects in a complex visual context: what we wish to see
auteur
Hugo Boujut, Aurélie Bugeau, Jenny Benois-Pineau
article
2013
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00785701/file/CRCBook_Saliency_boujut_bugeau_benois-pineau.pdf BibTex

2012

Journal articles

titre
Prediction of Alzheimer's disease in subjects with mild cognitive impairment from the ADNI cohort using patterns of cortical thinning.
auteur
Simon Eskildsen, Pierrick Coupé, Daniel García-Lorenzo, Vladimir Fonov, Jens C Pruessner, D Louis Collins
article
NeuroImage, Elsevier, 2012, 65, pp.511-521. <10.1016/j.neuroimage.2012.09.058>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00740247/file/Eskildsen_NeuroImage2012_HALversion.pdf BibTex
titre
Scoring by nonlocal image patch estimator for early detection of Alzheimer's disease
auteur
Pierrick Coupé, Simon Eskildsen, Jose Manjon, Vladimir Fonov, Jens Pruessner, Michèle Allard, Louis Collins
article
Neuroimage: Clinical, 2012, 1 (1), pp.141-152. <10.1016/j.nicl.2012.10.002>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00773040/file/Coupe_NeuroImageClinical2012_HAL.pdf BibTex
titre
Nonlocal regularization for active appearance model: Application to medial temporal lobe segmentation.
auteur
Shiyan Hu, Pierrick Coupé, Jens C Pruessner, D Louis Collins
article
Human Brain Mapping, Wiley, 2012, epub ahead of print. <10.1002/hbm.22183>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00736864/file/Hu_HBM2012.pdf BibTex
titre
Validation of a hybrid Doppler ultrasound vessel-based registration algorithm for neurosurgery.
auteur
Sean Jy-Shyang Chen, Ingerid Reinertsen, Pierrick Coupé, Charles X B Yan, Laurence Mercier, D Rolando Del Maestro, D Louis Collins
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2012, 7 (5), pp.667-85. <10.1007/s11548-012-0680-y>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683736/file/hal-00683736_edited.pdf https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683736/file/SeanJSCHEN_IJCARS2012.pdf BibTex
titre
Image editing with spatiogram transfer
auteur
Nicolas Papadakis, Aurélie Bugeau, Vicent Caselles
article
IEEE Transactions on Image Processing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2012, 21 (5), pp.2513 - 2522. <10.1109/TIP.2012.2183144>
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titre
A CANDLE for a deeper in vivo insight.
auteur
Pierrick Coupé, Martin Munz, Jose V Manjón, Edward S Ruthazer, D. Louis Collins
article
Med Image Anal, Elsevier, 2012, 16 (4), pp.849-64. <10.1016/j.media.2012.01.002>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00676241/file/hal-00676241_edited.pdf https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00676241/file/CANDLE_Paper.pdf BibTex
titre
Simultaneous segmentation and grading of anatomical structures for patient's classification: application to Alzheimer's disease.
auteur
Pierrick Coupé, Simon F Eskildsen, José V Manjón, Vladimir Fonov, D Louis Collins
article
NeuroImage, Elsevier, 2012, 59 (4), pp.3736-47. <10.1016/j.neuroimage.2011.10.080>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00645589/file/Coupe_Neuroimage2011_HALversion.pdf BibTex
titre
BEaST: brain extraction based on nonlocal segmentation technique.
auteur
Simon Eskildsen, Pierrick Coupé, Vladimir Fonov, José Manjón, Kelvin Leung, Nicolas Guizard, Shafik Wassef, Lasse Riis Ostergaard, D Louis Collins
article
NeuroImage, Elsevier, 2012, 59 (3), pp.2362-73. <10.1016/j.neuroimage.2011.09.012>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00629187/file/BEaST_HAL_version.pdf BibTex
titre
New methods for MRI denoising based on sparseness and self-similarity.
auteur
José Manjón, Pierrick Coupé, Antonio Buades, D. Louis Collins, Montserrat Robles
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2012, 16 (1), pp.18-27. <10.1016/j.media.2011.04.003>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00601866/file/New_methods_for_MRI_Denoising_based_on_Sparseness_and_Self-Similarity.pdf BibTex

Conference papers

titre
Multi-atlas labeling with population-specific template and non-local patch-based label fusion
auteur
Vladimir Fonov, Pierrick Coupé, Simon Eskildsen, Jose Manjon, Louis Collins
article
MICCAI 2012 Workshop on Multi-Atlas Labeling, Oct 2012, Nice, France. pp.63-66, 2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00739285/file/vfonov-multiatlas-challenge-v2.pdf BibTex
titre
Robust individual template pipeline for longitudinal MR images
auteur
Nicolas Guizard, Vladimir Fonov, Bérengère Aubert-Broche, Daniel García-Lorenzo, Pierrick Coupé, Simon Eskildsen, D. Louis Collins
article
MICCAI 2012 Workshop on Novel Biomarkers for Alzheimer's Disease and Related Disorders, Oct 2012, France. pp.231, 2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00740708/file/Guizard_MNI_NIBAD12_fullarticle.pdf BibTex
titre
Improving prediction of Alzheimer's disease using patterns of cortical thinning and homogenizing images according to disease stage
auteur
Simon Eskildsen, Pierrick Coupé, Daniel García-Lorenzo, Vladimir Fonov, Jens Pruessner, Louis Collins
article
MICCAI 2012 Workshop on Novel Imaging Biomarkers for Alzheimer's Disease and Related Disorders, Oct 2012, Nice, France. pp.79-90, 2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00740242/file/Eskildsen_NIBAD2012.pdf BibTex
titre
SNIPE: A New Method to Identify Imaging Biomarker for Early Detection of Alzheimer's Disease
auteur
Pierrick Coupé, Simon Eskildsen, José Manjón, Vladimir Fonov, Jens Pruessner, Michèle Allard, Louis Collins
article
MICCAI 2012 Workshop on Novel Biomarkers for Alzheimer's Disease and Related Disorders, Oct 2012, Nice, France. pp.41-51, 2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00739288/file/MICCAI2012_NIBAD_Coupe.pdf BibTex
titre
A new framework for analyzing structural volume changes of longitudinal brain MRI data
auteur
Bérengère Aubert-Broche, Vladimir Fonov, Daniel García-Lorenzo, Abderazzak Mouiha, Nicolas Guizard, Pierrick Coupé, Simon Eskildsen, Louis Collins
article
Spatio-temporal Image Analysis for Longitudinal and Time-Series Image Data, Oct 2012, Nice, France. 7570, pp.50-62, 2012, LNCS
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00739286/file/MICCAI_STIA_AB.pdf BibTex
titre
Visualizing stages of cortical atrophy in progressive MCI from the ADNI cohort
auteur
Simon Eskildsen, Vladimir Fonov, Pierrick Coupé, Louis Collins
article
Alzheimer's Association International Conference, Jul 2012, Vancouver, Canada. epub ahead of print, 2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00716199/file/Eskildsen_AAIC2012.pdf BibTex
titre
Patch-Based Morphometry: Application to Alzheimer's Disease
auteur
Pierrick Coupé, José Manjón, Vladimir Fonov, Simon Eskildsen, Louis Collins
article
Alzheimer's Association International Conference, Jun 2012, Vancouver, Canada. epub ahead of print, 2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00684705/file/Coupe_AAIC2012.pdf BibTex
titre
Automatic lateral ventricle segmentation in infant population with high risk of autism
auteur
Vladimir Fonov, Pierrick Coupé, Martin Styner, Louis Collins
article
Organization for Human Brain Mapping, Jun 2012, Beijing, China
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683773/file/FonovOHBM2012.pdf BibTex
titre
Superresolution improves MRI cortical segmentation with FACE
auteur
Simon Eskildsen, José Manjón, Pierrick Coupé, Vladimir Fonov, Louis Collins
article
Organization for Human Brain Mapping, Jun 2012, Beijing, China
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00683767/file/EskildsenOHBM2012.pdf BibTex
titre
DWI denoising using overcomplete Local PCA Decomposition
auteur
José Manjón, Pierrick Coupé, Luis Concha, Antoni Buades, Louis Collins, Montserrat Robles
article
ISMRM 20th Annual Meeting, May 2012, Melbourne, Australia. pp.3580, 2012
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BibTex
titre
Mots visuels issus de graphes locaux multi-niveaux pour la reconnaissance d'objets
auteur
Svebor Karaman, Jenny Benois-Pineau, Rémi Mégret, Aurélie Bugeau
article
RFIA 2012 (Reconnaissance des Formes et Intelligence Artificielle), Jan 2012, Lyon, France. pp.978-2-9539515-2-3, 2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00656516/file/rfia2012_submission_92.pdf BibTex
titre
Multi-Layer Local Graph Words for Object Recognition
auteur
Svebor Karaman, Jenny Benois-Pineau, Rémi Mégret, Aurélie Bugeau
article
International Conference on MultiMedia Modeling, Jan 2012, Klagenfurt, Austria. pp.29-39, 2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00637120/file/CameraReadyMMM2012_12p.pdf BibTex
titre
Relaxed Cheeger Cut for Image Segmentation
auteur
Ludovic Paulhac, Vinh-Thong Ta, Rémi Mégret
article
International Conference on Pattern Recognition, 2012, Tsukuba, Japan. 2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00708970/file/icpr12.pdf BibTex
titre
Patch-based Image Colorization
auteur
Aurélie Bugeau, Vinh-Thong Ta
article
International Conference on Pattern Recognition, 2012, Tsukuba, Japan. 2012
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00708969/file/icpr2012.pdf BibTex
titre
Nonlocal PdEs on graphs for active contours models with applications to image segmentation and data clustering
auteur
Olivier Lezoray, Abderrahim Elmoataz, Vinh-Thong Ta
article
International Conference on Acoustics, Speech, and Signal Processing, 2012, Kyoto, Japan. pp.873 - 876-, 2012, <10.1109/ICASSP.2012.6288023>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00708972/file/Lezoray_ICASSP2012.pdf BibTex

Book sections

titre
Spatial and multi-resolution context in visual indexing
auteur
Jenny Benois-Pineau, Aurélie Bugeau, Svebor Karaman, Rémi Mégret
article
Springer. Visual Indexing and Retrieval, Springer, 2012, Springerbriefs in Computer Science, ISBN 978-1-4614-3587-7
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BibTex
titre
Partial difference equations on graphs for local and nonlocal image processing
auteur
Abderrahim Elmoataz, Olivier Lezoray, Vinh-Thong Ta, Sébastien Bougleux
article
Olivier Lézoray and Léo Grady. Image Processing and Analysis with Graphs: Theory and Practice, CRC Press / Taylor & Francis, Chapter 7 - pp. 175-206, 2012
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2011

Journal articles

titre
Adaptive Multiresolution Non-Local Means Filter for 3D MR Image Denoising
auteur
Pierrick Coupé, José Manjón, Montserrat Robles, Louis Collins
article
IET Image Processing, Institution of Engineering and Technology, 2011
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00645538/file/Coupe_IETIP2011.pdf BibTex
titre
3D Rigid Registration of Intraoperative Ultrasound and Preoperative MR Brain Images based on Hyperechogenic Structures
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Xavier Morandi, Christian Barillot
article
International Journal of Biomedical Imaging, Hindawi Publishing Corporation, 2011, pp.53131
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00645546/file/Coupe_JIBI2011.pdf BibTex
titre
Appearance-based modeling for segmentation of hippocampus and amygdala using multi-contrast MR imaging.
auteur
Shiyan Hu, Pierrick Coupé, Jens Pruessner, Louis Collins
article
NeuroImage, Elsevier, 2011, 58 (2), pp.549-59. <10.1016/j.neuroimage.2011.06.054>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00610417/file/Hu_Neuroimage2011.pdf BibTex
titre
Patch-based segmentation using expert priors: Application to hippocampus and ventricle segmentation.
auteur
Pierrick Coupé, José Manjón, Vladimir Fonov, Jens Pruessner, Montserrat Robles, D Louis Collins
article
NeuroImage, Elsevier, 2011, 54 (2), pp.940-954. <10.1016/j.neuroimage.2010.09.018>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00541534/file/PatchBased_Segmentation_Neuroimage_HAL_VERSION.doc.pdf BibTex
titre
Tracking with Occlusions via Graph Cuts
auteur
Nicolas Papadakis, Aurélie Bugeau
article
IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 33 (1), pp.144-157. <10.1109/TPAMI.2010.56>
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BibTex
titre
Simultaneous segmentation and grading of hippocampus for patient classification with Alzheimer's disease.
auteur
Pierrick Coupé, Simon F Eskildsen, José V Manjón, Vladimir Fonov, D Louis Collins
article
Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI .. International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Springer, 2011, 14 (Pt 3), pp.149-57
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00639151/file/CoupeMICCAI2011_Grading.pdf BibTex
titre
Multi-resolution graph-based analysis of histopathological whole slide images: application to mitotic cell extraction and visualization
auteur
Vincent Roullier, Olivier Lezoray, Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz
article
Computerized Medical Imaging and Graphics, Elsevier, 2011, 35, pp.603-615
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BibTex
titre
Nonlocal PDEs-based Morphology on Weighted Graphs for Image and Data Processing
auteur
Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz, Olivier Lezoray
article
IEEE Transactions on Image Processing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2011, 26 (2), pp.1504-1516
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Conference papers

titre
Exemplar-based Imputation of Large Missing Audio Parts Using String Matching on Tonal Features
auteur
Benjamin Martin, Pierre Hanna, Vinh-Thong Ta, Myriam Desainte-Catherine, Pascal Ferraro
article
12th International Society for Music Information Retrieval Conference, Oct 2011, Miami, United States. pp.507--512, 2011
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BibTex
titre
Validation of appearance-model based segmentation with patch-based refinement on medial temporal lobe structures
auteur
Shiyan Hu, Pierrick Coupé, Jens Pruessner, Louis Collins
article
MICCAI Workshop on Multi-Atlas Labeling and Statistical Fusion, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.28-37, 2011
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00614308/file/MTLsegMICCAI.pdf BibTex
titre
BEaST: Brain extraction using multiresolution nonlocal segmentation.
auteur
Simon Eskildsen, Pierrick Coupé, Kelvin Leung, Vladimir Fonov, Nicolas Guizard, Shafik Wassef, Lasse Ostergaard, Louis Collins
article
MICCAI Workshop on Multi-Atlas Labeling and Statistical Fusion, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.97-108, 2011
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00614307/file/BeastMICCAI.pdf BibTex
titre
Prediction of MCI converters in the ADNI cohort using patterns of cortical thinning
auteur
Simon Eskildsen, Vladimir Fonov, Pierrick Coupé, Lasse Ostergaard, Louis Collins
article
Alzheimer's Association International Conference, Jul 2011, France. 7 (4), pp.S211, 2011
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BibTex
titre
Atrophy specific MRI brain template for Alzheimer's disease and Mild Cognitive Impairment
auteur
Vladimir Fonov, Pierrick Coupé, Simon Eskildsen, Louis Collins
article
Alzheimer's Association International Conference, Jul 2011, France. 7 (4), pp.S58, 2011
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00645521/file/Fonov_ICAD2012.pdf BibTex
titre
Influence of the Training Library Composition on a Patch-based label fusion method: Application to Hippocampus Segmentation on ADNI dataset.
auteur
Pierrick Coupé, Vladimir Fonov, Simon Eskildsen, José Manjón, Douglas Arnold, Louis Collins
article
Alzheimer's Association International Conference, Jul 2011, France. 7 (4), pp.S24, 2011
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00645526/file/ICAD2011_coupe.pdf BibTex
titre
Stereoscopic Image Inpainting using scene geometry
auteur
Alexandre Hervieu, Nicolas Papadakis, Aurélie Bugeau, Pau Gargallo I Piracés, Vicent Caselles
article
ICME 2011 - IEEE International Conference on Multimedia and Expo, Jul 2011, Barcelona, Spain. IEEE, pp.1-6, 2011, <10.1109/ICME.2011.6011901>
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https://hal.inria.fr/inria-00622591/file/inp.pdf BibTex
titre
Temporally consistent gradient domain video editing
auteur
Gabriele Facciolo, Rida Sadek, Aurélie Bugeau, Vicent Caselles
article
International Conference on Energy Minimization Methods, Jul 2011, Saint Petersburg, Russia. pp.59-73, 2011
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https://hal.inria.fr/inria-00601455/file/emmcvpr_new5c_final.pdf BibTex
titre
Robust fusion of Jacobian maps for Deformation-Based Morphometry
auteur
Nicolas Guizard, Pierrick Coupé, Vladimir Fonov, Douglas Arnold, Louis Collins
article
Organization for Human Brain Mapping 2011 Annual Meeting, Jun 2011, Canada
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00645486/file/Guizard_OHBM2012.pdf BibTex
titre
MRI denoising based on Sparseness and Self-Similarity
auteur
José Manjón, Pierrick Coupé, Antoni Buades, Louis Collins, Montserrat Robles
article
Organization for Human Brain Mapping 2011 Annual Meeting, Jun 2011, Canada
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00645489/file/Manjon_HBM2011.pdf BibTex
titre
Effect of non-local means denoising on cortical segmentation accuracy with FACE
auteur
Simon Eskildsen, Pierrick Coupé, Vladimir Fonov, Lasse Riis Ostergaard, Louis Collins
article
Organization for Human Brain Mapping 2011 Annual Meeting, Jun 2011, Canada
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00645491/file/OHBM2011_FACE.pdf BibTex
titre
Validation of basal ganglia segmentation on a 3T MRI template
auteur
Claire Haegelen, Nicolas Guizard, Pierrick Coupé, Florent Lalys, Pierre Jannin, Xavier Morandi, D. Louis Collins
article
Human Brain Mapping, Jun 2011, Quebec City, Canada
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00632521/file/Abstract-HBM.pdf BibTex
titre
Prediction of Alzheimer's Disease in Subjects with Mild Cognitive Impairment Using Structural Patterns of Cortical Thinning
auteur
Simon Eskildsen, Vladimir Fonov, Pierrick Coupé, Lasse Riis Ostergaard, Louis Collins
article
15th Nordic-Baltic Conference on Biomedical Engineering and Medical Physics (NBC 2011), Jun 2011, Denmark. 34, pp.156-159, 2011
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BibTex
titre
Représentation multi-échelle hiérarchique de données définies sur des graphes
auteur
Moncef Hidane, Olivier Lezoray, Abderrahim Elmoataz, Vinh-Thong Ta
article
GRETSI 2011, 2011, Bordeaux, France. 4 pp, 2011
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00708978/file/Hidane_Gretsi2011.pdf BibTex
titre
Segmentation d'images multi-résolution : application à l'extraction des mitoses en imagerie histologique
auteur
Vincent Roullier, Olivier Lezoray, Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz
article
GRETSI, 2011, Bordeaux, France. 2011
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00708977/file/Roullier_Gretsi2011.pdf BibTex

Patents

titre
Exemplar Based Assignment of Large Missing Audio Parts using String Matching on Tonal Features
auteur
Benjamin Martin, Pierre Hanna, Vinh-Thong Ta, Myriam Desainte-Catherine, Julien Allali, Matthias Robine, Pascal Ferraro
article
United States, Patent n° : US61/547,854. 2011
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2010

Journal articles

titre
Non-local MRI upsampling.
auteur
José Manjón, Pierrick Coupé, Antonio Buades, Vladimir Fonov, D. Louis Collins, Montserrat Robles
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2010, 14 (6), pp.784-92. <10.1016/j.media.2010.05.010>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00506797/file/Non_Local_MRI_Upsampling.pdf BibTex
titre
A Comprehensive Framework for Image Inpainting
auteur
Aurélie Bugeau, Marcelo Bertalmio, Vicent Caselles, Guillermo Sapiro
article
IEEE Transactions on Image Processing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2010, pp.2634 - 2645. <10.1109/TIP.2010.2049240>
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titre
Robust Rician noise estimation for MR images.
auteur
Pierrick Coupé, José Manjón, Elias Gedamu, Douglas Arnold, Montserrat Robles, D Louis Collins
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2010, 14 (4), pp.483-93. <10.1016/j.media.2010.03.001>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00486495/file/FinalVersionResub_last.pdf BibTex
titre
Real time ultrasound image denoising
auteur
Fernanda Palhano Xavier de Fontes, Guillermo Andrade Barroso, Pierrick Coupé, Pierre Hellier
article
Journal of Real-Time Image Processing, Springer Verlag, 2010, <10.1007/s11554-010-0158-5>
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https://hal.inria.fr/inria-00476122/file/JRTIP.pdf BibTex
titre
An automatic geometrical and statistical method to detect acoustic shadows in intraoperative ultrasound brain images
auteur
Pierre Hellier, Pierrick Coupé, Xavier Morandi, D. Louis Collins
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2010, 14 (2), pp.195-204. <10.1016/j.media.2009.10.007>
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https://hal.inria.fr/inria-00432724/file/Final.pdf BibTex
titre
Adaptive non-local means denoising of MR images with spatially varying noise levels.
auteur
José Manjón, Pierrick Coupé, Luis Martí-Bonmatí, D Louis Collins, Montserrat Robles
article
Journal of Magnetic Resonance Imaging, Wiley-Blackwell, 2010, 31 (1), pp.192-203. <10.1002/jmri.22003>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00454564/file/JMRIFinalVersion.pdf BibTex
titre
Partial differences as tools for filtering data on graphs
auteur
Olivier Lézoray, Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz
article
Pattern Recognition Letters, Elsevier, 2010, 31 (4), pp.2201-2213. <10.1016/j.patrec.2010.03.022>
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BibTex
titre
MRI superresolution using self-similarity and image priors.
auteur
José V Manjón, Pierrick Coupé, Antonio Buades, D Louis Collins, Montserrat Robles
article
International Journal of Biomedical Imaging, Hindawi Publishing Corporation, 2010, 2010, pp.425891. <10.1155/2010/425891>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00713324/file/Manjon2010.pdf BibTex

Conference papers

titre
Virtual camera synthesis for soccer game replays.
auteur
Nicolas Papadakis, Antonio Baeza, Xavier Armangué, Ignasi Rius, Aurélie Bugeau, Olivier D'Hondt, Pau Gargallo I Piraces, Vicent Caselles, Sergi Sagàs
article
Conference on Visual Media Production (CVMP'2010), Nov 2010, London, United Kingdom. pp.1-8, 2010
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BibTex
titre
Coherent Background Video Inpainting through Kalman Smoothing along Trajectories
auteur
Aurélie Bugeau, Pau Gargallo I Piracés, Olivier D'Hondt, Alexandre Hervieu, Nicolas Papadakis, Vicent Caselles
article
VMV 2010 - 15th International Workshop on Vision, Modeling, and Visualization Workshop, Nov 2010, Siegen, Germany. pp.123-130, 2010, <10.2312/PE/VMV/VMV10/123-130>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00522641/file/vmv_FINAL.pdf BibTex
titre
Nonlocal Patch-Based Label Fusion for Hippocampus Segmentation
auteur
Pierrick Coupé, Jose Vicente Manjon, Vladimir Fonov, Jens Pruessner, Montserrat Robles, Louis Collins
article
Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2010, Sep 2010, Beijing, China. 6363, pp.129-136, 2010, <10.1007/978-3-642-15711-0_17>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00524011/file/MICCAI2010-Camera-Ready.pdf BibTex
titre
Robust 3D Reconstruction and Mean-Shift Clustering of Motoneurons from Serial Histological Images
auteur
Nicolas Guizard, Pierrick Coupé, Nicolas Stifani, Stefano Stifani, D. Louis Collins
article
Medical Imaging and Augmented Reality (MIAR), Sep 2010, China. pp.191-199, 2010, <10.1007/978-3-642-15699-1>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00524109/file/Histo_clusterization_workshop_MIAR.pdf BibTex
titre
Template Construction using a Patch-based Robust Estimator
auteur
Pierrick Coupé, Vladimir Fonov, José Manjón, Louis Collins
article
Organization for Human Brain Mapping 2010 Annual Meeting, Jun 2010, Spain
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00645471/file/Coupe_OHBM2010.pdf BibTex
titre
Impact of Non-local Means filtering on Brain Tissue Segmentation
auteur
Christian Gaser, Pierrick Coupé
article
Organization for Human Brain Mapping 2010 Annual Meeting, Jun 2010, United States
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00645484/file/Gaser_OHBM2010.pdf BibTex
titre
A novel approach for high-resolution image reconstruction for in-vivo fetal brain MRI
auteur
Cedric Clouchoux, Pierrick Coupé, José Manjón, Nicolas Guizard, Marine Bouyssi-Kobar, Mylene Lefebvre, Adre Du Plessis, Alan Evans, Catherine Limperopoulos
article
Organization for Human Brain Mapping 2010 Annual Meeting, Jun 2010, United States
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00645477/file/Clouchoux_OHBM2010.pdf BibTex
titre
Intraoperative ultrasonography for the correction of brainshift based on the matching of hyperechogenic structures
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Xavier Morandi, Christian Barillot
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2010, Rotterdam, Netherlands. pp.1405 - 1408, 2010, <10.1109/ISBI.2010.5490261>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00515405/file/ISBI2009final.pdf BibTex
titre
Stereoscopic image inpainting: distinct depth maps and images inpainting
auteur
Alexandre Hervieu, Nicolas Papadakis, Aurélie Bugeau, Pau Gargallo I Piracés, Vicent Caselles
article
20th International Conference on Pattern Recognition, 2010, Turkey. pp.4101-4104,, 2010, <10.1109/ICPR.2010.997>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00551565/file/icpr2010_ThCT5.1.pdf BibTex
titre
Nonlocal Multiscale Hierarchical Decomposition on Graphs
auteur
Moncef Hidane, Olivier Lezoray, Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz
article
European Conference on Computer Vision, 2010, Heraklion, Crete, Greece. LNCS 6214, pp.638-650, 2010, <10.1007/978-3-642-15561-1_46>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00521070/file/eccv10.pdf BibTex
titre
Mitosis Extraction in Breast-Cancer Histopathological Whole Slide Images
auteur
Vincent Roullier, Olivier Lezoray, Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz
article
International Symposium on Visual Computing, 2010, Las Vegas, Nevada, United States. pp.539-548, 2010, <10.1007/978-3-642-17289-2_52>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00708980/file/Roullier_ISVC2010.pdf BibTex
titre
Efficient Algorithms for Image and High Dimensional Data Processing Using Eikonal Equation on Graphs
auteur
Xavier Desquesnes, Abderrahim Elmoataz, Olivier Lezoray, Vinh-Thong Ta
article
International Symposium on Visual Computing, 2010, Las Vegas, Nevada, United States. pp.647-658, 2010, <10.1007/978-3-642-17274-8_63>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00708981/file/Desquesnes_ISVC2010.pdf BibTex
titre
Graph-based multi-resolution segmentation of histological whole slide images
auteur
Vincent Roullier, Vinh-Thong Ta, Olivier Lezoray, Abderrahim Elmoataz
article
International Symposium on Biomedical Imaging, 2010, Netherlands. pp.153-156, 2010, <10.1109/ISBI.2010.5490390>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00521067/file/Isbi2010-2.pdf BibTex

Book sections

titre
Biomedical Microscopic Image Processing by Graphs
auteur
Vinh-Thong Ta, Olivier Lezoray, Abderrahim Elmoataz
article
Biomedical Image Analysis and Machine Learning Technologies: Applications and Techniques, Information Science Reference, pp.197-213, 2010
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BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
MRI Superresolution Using Self Similarity and Image Priors
auteur
Jose Vicente Manjon, Pierrick Coupé, Antoni Buades, D. Louis Collins, Montserrat Robles
article
MAP5 2010-06. 2010
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00453259/file/medical_map5.pdf BibTex

2009

Journal articles

titre
Nonlocal means-based speckle filtering for ultrasound images.
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Charles Kervrann, Christian Barillot
article
IEEE Transactions on Image Processing, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2009, 18 (10), pp.2221-9. <10.1109/TIP.2009.2024064>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00428524/file/TIP-04410-onecolumn.pdf BibTex
titre
Graph-based Tools for Microscopic Cellular Image Segmentation
auteur
Vinh-Thong Ta, Olivier Lezoray, Abderrahim Elmoataz, Sophie Schüpp
article
Pattern Recognition, Elsevier, 2009, 42 (6), pp.1113-1125
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BibTex
titre
An object-based method for Rician noise estimation in MR images.
auteur
Pierrick Coupé, Jose Vicente Manjon, Elias Gedamu, Douglas Arnold, Montserrat Robles, Louis Collins
article
Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI .. International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Springer, 2009, 12 (Pt 2), pp.601-8. <10.1007/978-3-642-04271-3_73>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00515408/file/MICCAI09STDFinal.pdf BibTex
titre
Graph-based tools for microscopic cellular image segmentation
auteur
Olivier Lézoray, Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz
article
Pattern Recognition, Elsevier, 2009, 42 (6), pp.1113-1125. <10.1016/j.patcog.2008.10.029>
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BibTex
titre
Detection and segmentation of moving objects in complex scenes
auteur
Aurélie Bugeau, Patrick Pérez
article
Computer Vision and Image Understanding, Elsevier, 2009, pp.ISSN:1077-3142. <10.1016/j.cviu.2008.11.005>
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BibTex

Conference papers

titre
Evaluation de la précision d'une méthode de recalage automatique échographie 3D intra-opératoire - IRM pré-opératoire en neurochirurgie
auteur
Pierre-Louis Henaux, Pierre Hellier, Pierre Jannin, Pierrick Coupé, Claire Haegelen, Sylma Diabara, Xavier Morandi
article
Congrès de la Société de Neurochirurgie de Langue Française, Dec 2009, paris, France. 2009
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BibTex
titre
Object-based Rician Noise Estimation for MR Images
auteur
Pierrick Coupé, José Manjón, Elias Gedamu, Douglas Arnold, Montserrat Robles, Louis Collins
article
Organization for Human Brain Mapping 2009 Annual Meeting, Jul 2009, United States. pp.s81, 2009, <10.1016/S1053-8119(09)70571-3>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00645453/file/Coupe_OHBM2009b.pdf BibTex
titre
Adaptive Multiresolution Denoising Filter for 3D MR Images
auteur
Pierrick Coupé, José Manjón, Montserrat Robles, Louis Collins
article
Organization for Human Brain Mapping 2009 Annual Meeting, Jun 2009, United States. 47, pp.S50, 2009, <10.1016/S1053-8119(09)70119-3>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00645467/file/Coupe_OHBM2009a.pdf BibTex
titre
Spatially Adaptive Non-local MRI Denoising
auteur
José Manjón, Pierrick Coupé, Luis Martí-Bonmatí, Louis Collins, Montserrat Robles
article
Organization for Human Brain Mapping 2009 Annual Meeting, Jun 2009, United States. 47, pp.S72, 2009, <10.1016/S1053-8119(09)70443-4>
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BibTex
titre
Combining Texture Synthesis and Diffusion for Image Inpainting.
auteur
Aurélie Bugeau, Marcelo Bertalmio
article
VISAPP 2009 - Proceedings of the Fourth International Conference on Computer Vision Theory and Applications, 2009, Portugal. pp.26-33, 2009
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00551587/file/visapp_m.pdf BibTex
titre
Manifold and Data Filtering on Graphs
auteur
Olivier Lezoray, Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz
article
International Workshop on Topological learning 2009, 2009, Lyon, France. 10 pp, 2009
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00410670/file/Lezoray_TopoLearn2009.pdf BibTex
titre
Nonlocal Graph Morphology
auteur
Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz, Olivier Lezoray
article
International Symposium on Mathematical Morphology, 2009, Groningen, Netherlands. pp.5-9, 2009, <10.1007/978-3-642-03613-2>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00403942/file/ISMM2009_2.pdf BibTex
titre
Morphologie Mathématique sur graphes pondérés de topologie arbitraire - Traitements non locaux d'images et de données multi-variées
auteur
Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz, Olivier Lezoray
article
Gretsi 2009, 2009, Dijon, France. 4 pp, 2009
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00403943/file/TA_GRETSI2009.pdf BibTex
titre
Adaptation of Eikonal Equation over Weighted Graphs
auteur
Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz, Olivier Lezoray
article
2nd International Conference on Scale Space and Variational Methods in Computer Vision (SSVM 09), 2009, Voss, Norway. LNCS (5567), pp.187-199, 2009, <10.1007/978-3-642-02256-2_16>
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00404070/file/VinhThongTA_09_ssvm.pdf BibTex

Theses

titre
Equations aux différences partielles définies sur des graphes pour le traitement d'images et de données
auteur
Vinh-Thong Ta
article
Interface homme-machine [cs.HC]. Université de Caen, 2009. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00472041/file/VinhThongTA_thesis.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Mathematical Morphology and Eikonal Equations on Graphs for Nonlocal Image and Data Processing
auteur
Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz, Olivier Lézoray
article
2009
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00365431/file/VinhThongTA_MMEE.pdf BibTex

2008

Journal articles

titre
Track and Cut: simultaneous tracking and segmentation of multiple objects with graph cuts
auteur
Aurélie Bugeau, Patrick Pérez
article
EURASIP Journal on Image and Video Processing, Springer, 2008, 2008, pp.Article ID 317278
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BibTex
titre
An optimized blockwise nonlocal means denoising filter for 3-D magnetic resonance images.
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Yger, Sylvain Prima, Pierre Hellier, Charles Kervrann, Christian Barillot
article
IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2008, 27 (4), pp.425-41. <10.1109/TMI.2007.906087>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00169658/file/Coupe07c.pdf http://www.hal.inserm.fr/inserm-00169658/file/inserm-00169658_edited.pdf BibTex
titre
3D Wavelet Sub-Bands Mixing for Image Denoising
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Sylvain Prima, Charles Kervrann, Christian Barillot
article
International Journal of Biomedical Imaging, Hindawi Publishing Corporation, 2008, pp.590183. <10.1155/2008/590183>
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https://hal.inria.fr/inria-00332001/file/Coupe08a.pdf BibTex

Conference papers

titre
Nonlocal Morphological Levelings by Partial Difference Equations over Weighted Graphs
auteur
Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz, Olivier Lézoray
article
19th International Conference on Pattern Recognition (ICPR 2008), Dec 2008, Tampa, United States. pp.1 - 4, 2008, <10.1109/ICPR.2008.4761413>
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00333396/file/VinhThongTA_08_icpr.pdf BibTex
titre
Partial Difference Equations on Graphs for Mathematical Morphology Operators overs Images and Manifolds
auteur
Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz, Olivier Lézoray
article
15th IEEE International Conference on Image Processing (ICIP), Oct 2008, San Diego, United States. pp.801-804, 2008, <10.1109/ICIP.2008.4711876>
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00333382/file/Ta_Icip08.pdf BibTex
titre
Partial Difference Equations over Graphs: Morphological Processing of Arbitrary Discrete Data
auteur
Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz, Olivier Lézoray
article
10th European Conference on Computer Vision (ECCV 2008), Oct 2008, Marseille, France. pp.668-680, 2008, LNCS 5304. <10.1007/978-3-540-88690-7_50 >
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00333390/file/VinhThongTA_08_eccv.pdf BibTex
titre
Rician noise removal by non-Local Means filtering for low signal-to-noise ratio MRI: applications to DT-MRI.
auteur
Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima, Pierrick Coupé, Sean Patrick Morrissey, Christian Barillot
article
11th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2008, New York, United States. Springer, 5242 (Pt 2), pp.171-9, 2008, <10.1007/978-3-540-85990-1_21>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00332388/file/Miccai08_DenoisingRician.pdf http://www.hal.inserm.fr/inserm-00332388/file/inserm-00332388_edited.pdf BibTex
titre
Bayesian Non Local Means-Based Speckle filtering
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Charles Kervrann, Christian Barillot
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, May 2008, Paris, France. 2008
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https://hal.inria.fr/inria-00283477/file/Coupe08c.pdf BibTex
titre
Acoustic shadows detection, application to accurate reconstruction of 3D intraoperative ultrasound
auteur
Pierre Hellier, Pierrick Coupé, Pierre Meyer, Xavier Morandi, D. Louis Collins
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, May 2008, Paris, France. 2008
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https://hal.inria.fr/inria-00283473/file/ISBI_final.pdf BibTex
titre
Nonlocal graph regularization for image colorization
auteur
Olivier Lezoray, Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz
article
International Conference on Pattern Recognition, 2008, Tampa, United States. 2008
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00332400/file/lezorayICPR2008_2_VF.pdf BibTex
titre
Impulse Noise Removal by Spectral Clustering and Regularization on Graphs
auteur
Olivier Lezoray, Vinh-Thong Ta, Abderrahim Elmoataz
article
International Conference on Pattern Recognition, 2008, Tampa, United States. 2008
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00332401/file/lezorayICPR2008_1_VF.pdf BibTex
titre
Learning graph neighborhood topological order for image and manifold morphological processing
auteur
Olivier Lezoray, Abderrahim Elmoataz, Vinh-Thong Ta
article
IEEE International Conference on Computer and Information Technology, 2008, Australia. pp.350-355, 2008
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00329520/file/Lezoray_CIT2008.pdf BibTex
titre
Unifying local and nonlocal processing with partial difference operators on weighted graphs
auteur
Abderrahim Elmoataz, Olivier Lezoray, Sébastien Bougleux, Vinh-Thong Ta
article
International Workshop on Local and Non-Local Approximation in Image Processing, 2008, Switzerland. pp.11-26
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00329521/file/elmoataz_LNLA08.pdf BibTex
titre
Track and Cut: simultaneous tracking and segmentation of multiple objects with graph cuts.
auteur
Aurélie Bugeau, Patrick Pérez
article
International Conference on Computer Vision Theory and Applications (VISAPP' 08),, 2008, Portugal. p., 2008
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00551590/file/visapp.pdf BibTex

Theses

titre
Brain shift compensation in image-guided neurosurgery based on 3-D ultrasound
auteur
Pierrick Coupé
article
Signal and Image processing. Université Rennes 1, 2008. English
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00328179/file/PhD_coupe08.pdf BibTex

2007

Journal articles

titre
Simulation of biphasic CT findings in hepatic cellular carcinoma by a two-level physiological model.
auteur
Marek Kretowski, Johanne Bezy-Wendling, Pierrick Coupé
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2007, 54 (3), pp.538-42. <10.1109/TBME.2006.888834>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00144365/file/Kretowski_Bezy.pdf BibTex
titre
Probe Trajectory Interpolation for 3D Reconstruction of Freehand Ultrasound
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Xavier Morandi, Christian Barillot
article
Medical Image Analysis, Elsevier, 2007
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https://hal.inria.fr/inria-00154571/file/Coupe_Media07.pdf BibTex

Conference papers

titre
Non-local means variants for denoising of diffusion-weighted and diffusion tensor MRI.
auteur
Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima, Pierrick Coupé, Sean Patrick Morrissey, Christian Barillot
article
10th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2007, Brisbane, Australia. Springer, 4792 (Pt 2), pp.344-51, 2007, <10.1007/978-3-540-75759-7_42>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00193788/file/Miccai07.pdf BibTex
titre
Bayesian non-local means filter, image redundancy and adaptive dictionaries for noise removal
auteur
Charles Kervrann, Jérôme Boulanger, Pierrick Coupé
article
SSVM'07 Proceedings of the 1st international conference on Scale space and variational methods in computer vision, May 2007, Ischia, Italy. 4485, pp.520-532, 2007
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00645444/file/2007_ssvm_kervrann.pdf BibTex
titre
A PROBABILISTIC OBJECTIVE FUNCTION FOR 3D RIGID REGISTRATION OF INTRAOPERATIVE US AND PREOPERATIVE MR BRAIN IMAGES
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Xavier Morandi, Christian Barillot
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2007, Washington DC, USA, United States. pp.1320-1323, 2007, Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 2007. ISBI 2007. 4th IEEE International Symposium on. <10.1109/ISBI.2007.357103>
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https://hal.inria.fr/inria-00147025/file/Coupe_ISBI2007.pdf BibTex
titre
Image Guidance in neurosurgical procedures, the "VISAGES" point of view
auteur
Christian Barillot, Pierrick Coupé, Bernard Gibaud, Pierre Hellier, Pierre Jannin, Xavier Morandi, Perrine Paul, Sylvain Prima, Nicolas Wiest-Daesslé, Omar El Ganaoui
article
Apr 2007, IEEE, pp.1056-1059, 2007, <10.1109/ISBI.2007.357037>
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http://www.hal.inserm.fr/inserm-00152147/file/barillotISBI07.pdf BibTex
titre
Detection and segmentation of moving objects in highly dynamic scenes
auteur
Aurélie Bugeau, Patrick Pérez
article
International Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, 2007, United States. p., 2007
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00551596/file/CVPR.pdf BibTex
titre
Joint Tracking and Segmentation of Objects using Graph Cuts.
auteur
Aurélie Bugeau, Patrick Pérez
article
ACIVS'07 Proceedings of the 9th international conference on Advanced concepts for intelligent vision systems, 2007, Netherlands
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00551593/file/paper160.pdf BibTex
titre
Sélection de la taille du noyau pour l'estimation à noyau dans des espaces multidimensionnels hétérogènes.
auteur
Aurélie Bugeau, Patrick Pérez
article
21ème colloque GRETSI sur le traitement du signal et des images, 2007, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00551598/file/Gretsi_final.pdf BibTex

Reports

titre
Bandwidth selection for kernel estimation in mixed multi-dimensional spaces
auteur
Aurélie Bugeau, Patrick Pérez
article
[Research Report] RR-6286, INRIA. 2007
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https://hal.inria.fr/inria-00171686/file/RR-6286.pdf BibTex
titre
Detection and segmentation of moving objects in complex scenes
auteur
Aurélie Bugeau, Patrick Perez
article
[Research Report] RR-6282, INRIA. 2007
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inria.fr/inria-00170360/file/RR-6282.pdf BibTex
titre
Track and Cut: simultaneous tracking and segmentation of multiple objects with graph cuts
auteur
Aurélie Bugeau, Patrick Pérez
article
[Research Report] RR-6337, INRIA. 2007, pp.23
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https://hal.inria.fr/inria-00181865/file/RR_suivi.pdf BibTex

Theses

titre
Détection et suivi d'objets en mouvement dans des scenes complexes, application a la surveillance des conducteurs.
auteur
Aurélie Bugeau
article
Interface homme-machine [cs.HC]. Université Rennes 1, 2007. Français
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00551601/file/These.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Nonlocal Anisotropic Discrete Regularization for Image, Data Filtering and Clustering
auteur
Vinh-Thong Ta, Sébastien Bougleux, Abderrahim Elmoataz, Olivier Lézoray
article
2007
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00187165/file/ta07nonlocal2.pdf BibTex

2006

Conference papers

titre
Fast Non Local Means Denoising for 3D MR Images
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Yger, Christian Barillot
article
Larsen, R. and Nielsen, M. and Sporring, J. 9th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Oct 2006, Copenhagen, Denmark, Springer, 4191, pp.33-40, 2006, LNCS; MICCAI'06. <10.1007/11866763_5>
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https://hal.inria.fr/inria-00131287/file/MICCAI2006.pdf BibTex

2005

Conference papers

titre
3D Freehand Ultrasound Reconstruction based on Probe Trajectory
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Noura Azzabou, Christian Barillot
article
Duncan, J. and Gerig, G. 8th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2005, Palm Springs, USA, Springer, 3749, pp.597-604, 2005, LNCS; MICCAI'05. <10.1007/11566465_74>
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https://hal.inria.fr/inria-00131284/file/MICCAI2005.pdf BibTex

Reports

titre
État de l'art des méthodes de correction des déformations cérébrales per-opératoires
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Christian Barillot
article
[Rapport de recherche] RR-5589, INRIA. 2005, pp.51
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https://hal.inria.fr/inria-00070418/file/RR-5589.pdf BibTex
titre
État de l'art des méthodes de correction des déformations cérébrales per-opératoires
auteur
Pierrick Coupé, Pierre Hellier, Christian Barillot
article
[Rapport de recherche] PI 1724, 2005, pp.51
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2004

Conference papers

titre
High frequency ultrasound characterization of the coagulation process of whole blood
auteur
Frédéric Ossant, R. Libgot, Pierrick Coupé, P. Lermusiaux, Frédéric Patat
article
Ultrasonics Symposium, 2004 IEEE, Aug 2004, Canada. pp.846-849, 2004, <10.1109/ULTSYM.2004.1417869>
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BibTex
titre
Modeling of tumor conspicuity in hepatic CT images: combined compartment and vascular models
auteur
Johanne Bézy-Wendling, Marek Kretowski, Pierrick Coupé
article
Biomedical Imaging: Nano to Macro, 2004. IEEE International Symposium on, Apr 2004, United States. pp.444-447, 2004, <10.1109/ISBI.2004.1398570>
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BibTex

Master thesis

titre
Attention visuelle multi-échelle
auteur
Aurélie Bugeau
article
Synthèse d'image et réalité virtuelle [cs.GR]. 2004
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https://hal.inria.fr/inria-00598476/file/ABugeau-DEA04.pdf BibTex